进行模拟,经常需要在Linux直接查看gro文件和出现pdb文件,所以有必要安装一个linux版的VMD
1.下载VMD软件(到官网注册账号就可以免费下载了),也可以用wget命令下载:
wget http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-1.9.3/files/final/vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz ./
2.用解压缩命令进行解压
gunzip vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz
tar -xvzf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar
3.解压后进入vmd-1.9.3目录进行安装
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./configure LINUXAMD64
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./configure
using configure.options: LINUXAMD64
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cd src
- sudo make install