gromacs5.x教程,gromacs5.x tutorial
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gromacs5.x tutorial

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这是从官网的教程完成的任务(gromacs tutorial),按照官网的步骤完成的。 注意的是不能随便的复制粘贴贴,不然很多时候会出现input error 的,因为 这可能是你忘记下载对应的文件了,有几个mdp文件要进行下载的,比如ntp.mdp。 点击官网的教程里面的链接可以直接打开对应的文件,复制对应的内容到编辑器 另存为对应的文件就行了,改名的话自己看改,建议不改。 ...

gromacs,gromacs5.0.6,gromacs config,linux install
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gromacs5.x 在linux安装

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首先下载软件 :http://www.gromacs.org/Downloads 选择你要安装的版本并下载到电脑,我下载到了Downloads文件夹了。 要安装fftw和cmake 先安装了cmake,我直接用centos7.2 yum命令安装的,不需要累赘说明配置。 然后我再安装fftw:下载最新的fftw后解压到文件夹》进入文件夹》运行在终端切换到该文件夹执行以下命令: ./co...

gromacs入门
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gromacs小案例

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////// //*********************4.5.3//// ///////////// pdb2gmx -f protein.pdb -o protein.gro -p protein.top -ignh ///////////////// grompp -v -f minim.mdp -c protein-water.gro -p protein.top -o pr...